රටේ වැදගත්ම ඉංජිනේරු පද්ධතියක් මඟින් හසුරුවන ඉංජිනේරු ආයතනයක් ලෙස, ජලය බෙදා හැරීම විධිමත්ව සිදු කිරීමට අවශ්‍ය ඉංජිනේරු සැලසුම් සහ ක්‍රමසම්පාදන බොහෝමයක් ජල සම්පාදන මණ්ඩලය සතුව ඇත. ක්‍රමසම්පාදන හා සැලසුම් අංශය සියලුම සැලසුම් කටයුතු සහ ඉංජිනේරු සැලසුම් හැසිරවීමේ වගකීම දරයි. ක්‍රමසම්පාදන හා සැලසුම් අංශය ජලය බෙදාහැරීමේ පද්ධතිය සඳහා වූ සියලුම ඉංජිනේරු සැලසුම් කටයුතු සහ ක්‍රමසම්පාදන කටයුතු හැසිරවීමේ වගකීම දරයි.

සැලසුම් හා ක්‍රමසම්පාදන අංශය ප්‍රතිපත්ති හා සැලසුම් අංශය යටතේ ක්‍රියාත්මක වේ. අති.සා (ප්‍රතිපත්ති හා සැලසුම්) යටතේ සහ නියෝජ්‍ය සාමාන්‍යාධිකාරී (ක්‍රමසම්පාදන හා සැලසුම්) විසින් ප්‍රධානත්වය දරනු ලබයි. ජල හා සනීපාරක්‍ෂක අංශවල විවිධ විෂය ක්ෂේත්‍රයන්හි විශේෂඥ ඉංජිනේරුවන් 30 කට අධික සංඛ්‍යාවකින් මෙම අංශය සමන්විත වේ.